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[10]总起来，从“由之而不知其道”
到知其所以然之故的进展，便表现为一个从形表（外部现象）到内在之理的过程。
严复的如上看法，明显地渗入了注重考察必然之理、普遍之道的传统哲学，在“即物穷理”
“道通为一”
等命题中，我们便可看到这一点。
不妨说，正是传统哲学的内在制约，使严复在接受实证主义原则的同时，又偏离了实证论之辙。
这种偏离，当然并非仅仅展示了哲学立场上的差异，它同时也表现了对科学方法的不同看法。
在严复看来，科学方法不仅仅适用于对外在现象的考察，而且也是把握普遍之道、必然之理的手段：通过实测及归纳、分析等理性的操作程序，人们便可以由外在的现象深入到普遍之道。
在这里，科学方法的合理性，似乎为达到普遍必然的知识提供了担保。
如果说，西方的实证论倾向于为科学方法的作用规定一个界限，那么，严复则更多地强调了科学方法的普遍有效性；后者与技进于道的科学观念演化过程相一致，并从方法论的层面对科学的泛化提供了支持。
对科学方法作用范围的不同规定，也体现在对科学知识的理解之上。
实证主义将科学法则规定为现象及现象间联系的描述，这同时也就意味着强调知识的相对性、不确定性，因为现象间的联系不管如何恒常，总是不可避免地带有相对的、不稳定的一面，而对它的描述，则往往受到主体的主观条件的制约。
正是基于这一前提，实证主义强调必须把知识视为依赖于主体的“相对的东西”
。
在这一问题上，严复所持的是另一种看法。
对严复来说，科学知识是总有其绝对性的一面，而这种绝对性又来自格致程序的普遍有效性：“格致之事，一公例既立，必无往而不融涣消释。”
[11]此所谓公例，既是指普遍的科学定律或定理，又涉及科学研究的一般程序，二者皆关联着科学方法：将公例引用于具体对象，并使之得到解释，这本身也是一个运用科学方法的过程。
严复强调以一般公例去解释具体对象“必无往而不融涣消释”
，实际上从解释的过程，肯定了科学方法的可靠性。
科学方法也就是所谓“术”
，一旦由术而得道，则可行彻五洲、学穷千古：“夫道无不在，苟得其术，虽近取诸身，岂有穷哉？而行彻五洲，学穷千古，亦将但见其会通而统于一而已矣。”
[12]彻五洲隐喻了空间的无限性，穷千古则表征了时间上的绵延恒久；在此，从横向的空间到纵向的时间，科学方法指向无限时空中的一切对象，并构成了知识统一所以可能的前提。
对科学方法普遍有效的这种确信，与实证主义的划界论（将科学认识限定于现象界）显然有所不同。
在严复与实证主义的如上分歧背后，我们既可以看到传统哲学的投影：公例无往而不适，在逻辑上即以道的普遍涵盖性为依据，而后者正是传统哲学根深蒂固的观念；又可以看到历史的内在制约：在严复那里，西学格致乃是中国走向近代化的必由之路，这种历史意识使严复对科学方法及科学知识充满了近乎天真的信赖，并相应地疏离了实证论对科学方法和科学知识的相对主义看法。
严复由分析实测内籀的内在环节，到强调科学方法的普遍有效性，表现了对科学方法的推崇。
科学方法内在环节的规定和分疏，着重从研究程序等方面突出了科学方法的合理性；科学方法普遍有效性的肯定，则已蕴含了科学方法万能的观念。
对科学合理性的注重和科学方法作用的确信，与科学进化论到天演哲学的提升相辅相成，似乎从思维方式等方面预示了20世纪科学主义的某种走向。
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