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实现会计电算化的最终目的是要完全取代手工操作、取代手工账簿，打印账簿只是权宜之计。
既然企事业单位的全部经济业务都已存储在磁性介质上，因此一切查询检索都可以直接在电子计算机上进行。
随着自动化程度逐渐提高，有关部门和人员（如上级机关或审计人员）都可根据需要配备计算机终端，查询或审计所需的会计数据。
但是，鉴于当前的实际情况，定期输出某些简化格式的账簿还是必要的。
由于能够以可靠的存储系统长期保存大量的信息，打印输出的账簿就可以适当从简。
比如，允许货币资金日记账采取活页簿；总账可以采用“总分类账户本期发生额对照表”
的形式代替（以表代账）；明细账可以定期满页打印，也可以在一张账页中打印几个分户等。
（4）人员分工和组织机构不同
会计电算化系统中的人员将由会计专业人员、电子计算机软件、硬件及操作人员组成。
要求这些人员是既懂会计知识，又懂电子计算机知识的复合型人才。
组织机构由原来有相互稽核牵制作用的专业组构成，改变为由会计数据处理部门、会计数据管理部门以及系统维护部门构成，形成一个新的内部控制网。
（5）内部控制制度不同
内部控制包括会计机构内部的牵制、稽核制度。
会计人员的岗位责任制等。
原手工操作时，会计机构的内部牵制在企事业单位中有各种明确的规定，如对会计凭证的编制、审核、批准的规定，对实物保管账证、账物的稽核制度，对出纳人员不得兼管稽核、会计档案保管和收入、费用、债务账目的登记工作等制度的规定。
实现会计电算化以后，会计人员的岗位及内部牵制制度将随之有所变化。
在一些中、小企业，经济业务比较简单，全部会计业务集中在1～2台单机上处理，会计人员的职责分工大体是制票、稽核、录入、校核、维护。
在大型或中型企业，经济业务比较复杂，分工较细，对各种会计事项的处理往往在网络环境下进行，而且每一个岗位的会计人员可以自行处理其岗位的业务，录入经过稽核的会计凭证要素，使之进入网络系统。
系统的中心接收其数据，并根据各个岗位的需要传输、调取、处理这些数据。
在这种情况下，制票、稽核、录入集中在一个岗位（不是集中在一个人），系统中心则负责校对与维护。
总之，无论是单机运行还是网络环境运行，原会计机构和会计人员都有了相应的变化，原手工操作时的一部分内部控制被计算机技术所代替，已转化为计算机自动控制，使原来的这些内部控制失去作用。
如账簿的平行登记、账与账之间的内部控制，将由计算程序自动完成，不会出现账证、账账、账表之间的不一致现象。
根据计算机软件和硬件的特点，还要制定一些电算化环境下的内部控制制度。
如软硬件维护制度、操作管理制度、数据管理制度、会计档案管理制度等。
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